الرئاسة العامة لشؤون المسجد الحرام والمسجد النبوي جهاز حكومي يرتبط مباشرة برئيس مجلس الوزراء ويرأس الجهاز رئيس بمرتبة وزير ويشغل هذا المنصب الآن معالي الشيخ الدكتور عبدالرحمن بن عبدالعزيز السديس .
ويقع مقر الرئاسة العامة لشؤون المسجد الحرام في مكة المكرمة قرب المسجد الحرام وتتبع الرئاسة وكالة مرتبطة بها للإشراف على المسجد النبوي الشريف مقرها المدينة المنورة .
ويعود تاريخ إنشائها إلى عام 1384هـ تحت مسمى:
الرئاسة العامة للإشراف الديني بالمسجد الحرام
لتقوم بمهام الإشراف على التوعية والإرشاد والتدريس والتوجيه ، والإمامة والخطابة في المسجد الحرام ، وأول رئيس لها سماحة الشيخ عبدالله بن محمد بن حميد – يرحمه الله –.
وفي عام 1397هـ صدر الأمر السامي الكريم رقم ( أ/265 ) في ( 6/11/1397هـ ) بإنشاء الرئاسة العامة لشؤون الحرمين الشريفين برئاسة الشيخ ناصر بن حمد الراشد – يرحمه الله – ثم ترأسها سماحة الشيخ سليمان بن عبيد، ثم سماحة الشيخ محمد بن عبدالله السبيل، ثم معالي الشيخ الدكتور صالح بن حميد رئيس مجلس الشورى، ثم معالي الشيخ صالح بن عبدالرحمن الحصين ، ويترأسها الآن معالي الشيخ عبدالرحمن السديس وفقه الله وفي عام 1398هـ صدر قرار اللجنة العليا للإصلاح الإداري رقم ( 79 ) في ( 30/1/1398هـ ) بالموافقة على مهام واختصاصات الرئاسة .
وفي عام 1407هـ صدر الأمر السامي الكريم رقم ( 7/ب/855 ) في ( 7/6/1407هـ ) بتغيير مسمى الرئاسة العامة لشؤون الحرمين الشريفين إلى الرئاسة العامة لشؤون المسجد الحرام والمسجد النبوي .
وفي عام 1414هـ صدر الأمر السامي الكريم رقم ( 7/ب/1098 ) في ( 15/7/1414هـ ) بضم مصنع كسوة الكعبة المشرفة إلى الرئاسة .
وتمارس الرئاسة المهام والاختصاصات المتعلقة بالحرمين الشريفين ومنها :
1- الإشراف الديني والإداري والفني والخدمي في كل من المسجد الحرام والمسجد النبوي الشريف .
2- القيام بمسؤولية الأمر بالمعروف والنهي عن المنكر بالحرمين الشريفين .
3- الإشراف على مكتبات الحرمين الشريفين .
4- القيام بمسؤولية سقيا زمزم والنظافة والفرش والصيانة بالحرمين الشريفين .
5- تخطيط وإدارة وتنفيذ المشاريع الإنشائية للحرمين الشريفين .
6- اشتراك الرئاسة في لجنة الحج العليا ولجنة الحج المركزية وعدد من اللجان .